Ola
Meu servidor proxy não me permite tracar rota a nenhum ip ou sites da net.

Sendo que preciso acessar um site que utiliza java para leitura digital e o mesmo da timeout, segundo os donos do site e necessario que eu tracer uma rota para o site e ai é que estar o meu ploblema , penso eu que colocando a maquina que irar acessar o site por fora do proxy assim resolver o meu problema.

neros, poderia fazer um teste pra ver se é proxy ou firewall que está bloqueando isso, "desviando" através de uma regra de firewall essa maquina que vc está usando. Assim ela não passaria pelo proxy aí vc conseguiria ver quem está fazendo esse bloqueio.

tente com essa regra:
iptables -t nat -A POSTROUTING -o eth1 -s $IP_DA_MAQUINA -p tcp -j MASQUERADE